西南交通大学审计处于2011年10月正式作为处级建制独立设置。现下设综合审计科、财务审计科、工程审计科三个职能部门，现有人员12人，其中高级职称4人，中级职称8人，博士2人，硕士9人，本科1人。

审计处根据《中华人民共和国审计法》、《中华人民共和国审计法实施条例》（国务院第231号令）、《中华人民共和国国家审计准则》（审计署第8号令）、《审计署关于内部审计工作的规定》（审计署第11号令）和《教育系统内部审计工作规定》（教育部第47号令）等法律、法规以及学校的规章制度，围绕学校的根本任务和中心工作，对学校及所属单位财政财务收支、经济活动、内部控制、风险管理等实施独立、客观的监督、评价和建议，促进学校完善治理，保障学校事业持续健康发展。